В Европе Наката выступал за "Перуджу", "Рому", "Парму", "Болонью", "Фиорентину" и "Болтон". Наката - победитель Кубка Азии 1996, Чемпион Италии 2001 в составе "Ромы" и обладатель Кубка Италии 2002 ("Парма"). После Чемпионата мира 2006 Наката закончил карьеру. Сейчас занимается бизнесом.